1、脂質體轉染法

陽離子脂質體表面帶正電荷，能與核酸的磷酸根通過靜電作用，將DNA分子包裹入內，形成DNA脂復合物，也能被表面帶負電的細胞膜吸附，再通過融合或細胞內吞進入細胞。脂質體轉染適用于把DNA轉染入懸浮或貼壁培養細胞中，是目前實驗室轉染方法之一，其轉染率較高，優于磷酸鈣法。

2、磷酸鈣共沉淀法

該方法可重復性差，而且磷酸鈣溶液對溫度、pH和緩沖鹽濃度的變化十分敏感，對細胞尤其是原代細胞毒性較大，也不能采用RPMI培養基，因為其含有高濃度的磷酸鹽。

3、電穿孔轉染法

電流能夠可逆地擊穿細胞膜形成瞬時的小孔促使DNA分子進入胞內，這種方法就是電穿孔。
當遇到某些脂質體轉染效率很低或幾乎無法轉入時可以用電穿孔法轉染。
一般情況下，高電場強度會殺死50%-70% 的細胞。現在針對細胞死亡開發出了一種電轉保護劑，可以大大的降低細胞的死亡率，同時提高電穿孔轉染效率。

4、病毒感染

對于脂質體轉染與電穿孔轉染都無法成功轉染的細胞系可以采用病毒感染，腺病毒，腺相關病毒，逆轉錄病毒和慢病毒載體已廣泛用于哺乳動物細胞體內外的基因轉染，轉染效率比較高，適用于較難轉染的細胞。
但是插入的片段長度有一定限制，最重要的是技術難度比較高，在一般實驗室中很難普及，而且某些病毒起效時間比較慢，跟不上細胞這種快速繁殖的速度，如果只是做簡單細胞系的轉染性價比不高。

沒有一種方法適用于所有的細胞和實驗，理想的方法應根據細胞類型和實驗需要進行選擇，如果只是在細胞水平做，而且用的是簡單細胞系，那么脂質體轉染是綜合比較起來不錯的一個方法。